Sau trận tàn phá của Pain ngay ngày đầu năm thì sáng hôm sau dân làng đã bắt đầu lại việc xây dựng mọi thứ. Những người đã chết nay được sống lại và cả những người sống sót trong đại hoạ dường như đã hiểu ra điều gì đó khiến họ chạy lại gia đình trong những giọt nước mắt vỡ oà vì hạnh phúc. Tài sản, nhà cửa có thể mất nhưng gia đình, bạn bè còn đây đã trở thành một nguồn động lực mới để họ xây dựng lại làng. Cha mẹ Sakura đã vui mừng khôn xiết khi gặp lại đứa con gái bé bỏng của mình và cậu em liều lĩnh. Sakura, Sai và Naruto đã gặp lại hai người thầy của mình, đặc biệt là thầy Kakashi khi thầy ấy đã được hồi sinh. Cô cũng rất hạnh phúc khi gặp lại Shizune nhưng niềm vui của họ chẳng tày gang vì cô Tsunade đã bị thương rất nặng, nguồn chakra cạn kiệt đến mức đáng báo động. Tsunade giờ đây đang nằm hôn mê trong bệnh viện với đám dây nhợ chằng chịt cùng những vị y nhẫn ngày đêm cứu sống bà ấy, trong đó có cả Sakura và Shizune. Sau một buổi tích cực điều trị, tình trạng của bà ấy đã không còn nguy hiểm nhưng để bà ấy tỉnh lại thì cần một khoảng thời gian dài để bà ấy hấp thụ thêm chakra. Vậy là chiếc ghế Hokage sẽ tạm bỏ trống.

Trong lúc dân làng đang hồ hởi dọn dẹp và kiến thiết lại mọi thứ thì ở một căn hầm trong làng, có những kẻ vẫn lén lút cho những mưu đồ đen tối của mình.

- Ha... Thời cơ đã chín muồi...

Tiếng gậy gỗ "cộc", "cộc" vang lên lanh lảnh trong đường hầm tối và dài.

Trong phòng hội đồng lúc này đang diễn ra một cuộc họp cực kì quan trọng: chọn Hokage thay thế tạm thời vị trí Hokage Đệ Ngũ Tsunade. Lẽ ra cuộc họp này sẽ không diễn ra nếu như một tháng nữa là Đại hội Ngũ đại Kage tại Kim quốc do Mifune – lãnh chúa Kim quốc đứng ra chủ trì – sẽ bắt đầu. Hội nghị Ngũ đại Kage là hội nghị giữa các kage đứng đầu năm cường quốc nhằm thảo luận về vấn đề tổ chức Akatsuki và Konoha đã nhận được thư mời ngay sáng nay nên hội đồng phải họp khẩn để chọn ra Hokage Đệ Lục. Sau khi bàn bạc, thống nhất, họ quyết định chọn Hakate Kakashi nhậm chức này vì lí lịch tốt cùng kinh nghiệm dày dặn của anh. Nhưng ở giữa chừng của cuộc họp, Danzo xông vào làm gián đoạn và hắn đã đề cử mình làm Hokage:

- Vì sự phát triển và an toàn của làng, ta sẽ làm Hokage.

- Hokage tiếp theo đã được chọn.

- Các ngươi nên suy nghĩ lại...

Vài giờ sau, trong làng vang lên âm thanh thông báo về vị Hokage tiếp theo:

- Người sẽ giữ chức Hokage Đệ Lục thay thế cho Hokage Đệ Ngũ là Shimura Danzo. Buổi lễ nhậm chức sẽ được tiến hành sau một tháng nữa.

Thông báo vừa đưa ra khiến mọi người trong làng đều bất ngờ, nhất là Sakura vì cô không nghĩ lão già với cái tư tưởng quân phiệt đó sẽ trở thành Hokage. Hắn mà thành Hokage thì cái làng này sẽ đi về đâu?

Ở nhà của Haruno, Kan đang dọn dẹp lại mớ hỗn độn trong nhà. May mà trước khi rời khỏi anh đã kịp phong ấn những thứ quan trọng vào nơi an toàn, bây giờ chỉ cần lôi chúng ra ngoài, cất lại nhà là được. Anh đang hỗ trợ thợ xây bằng cách nâng khung gầm giúp họ. Một ngôi nhà nhỏ dần được hình thành từ những cây cột nhỏ. Trong lúc đó, anh đã nghe tin về Hokage mới. Anh không ngạc nhiên khi Danzo trở thành Hokage vì anh biết rõ cái tên đó vẫn luôn chờ cái ngày này, cái ngày mà hắn được ngồi lên cái ghế Hokage mà hằng đêm hắn đều mơ thấy, thèm khát được ngồi lên để xây dựng ngôi làng theo ý hắn. Tuy nhiên, điều này sẽ gây không ít rắc rối cho gia đình anh vì có nhiều việc cần Hokage giúp đỡ. Anh đã báo cáo điều này cho Nữ thần vào giờ nghỉ trưa.

Ở một quán trà nhỏ thuộc ngoại ô làng Thác nước, có một cặp đôi đang ngồi uống trà, trên tay người nữ là một lá thư nhỏ. Ilmany đã nắm được tình hình của làng sau trận đại chiến hôm qua. Nữ thần không quá bất ngờ khi Danzo nắm giữ vị trí này vì đây là thời điểm thích hợp nhất để hắn danh chính ngôn thuận lấy được chức Hokage. Người đàn ông ngồi đối diện nói chuyện với Nữ thần:

- Chà, vậy là tên đó đã đạt được tham vọng của mình rồi.

- Ha, không ngoài dự đoán của em. Ngay khi biết Tsunade hôn mê thì em đã nghi ngờ việc này.

- Coi bộ sau này việc liên lạc và gọi Sakura, Kan cho những nhiệm vụ dài ngày sẽ khó khăn hơn. Nhưng anh thấy hắn chắc sẽ không giữ chức này được lâu đâu.

- Ồ, thế anh định...

- Thúc đẩy một chút sẽ không sao...

Vừa lúc đó, một nhóm người bước vào quán, lên thẳng trên lầu. Ilmany và Aistiqrar rất chú ý đến nhóm bốn người này. Họ ngay lập tức nhận ra:

- Chẳng phải chàng trai bỏ làng đi năm nào đây à? Cậu ta xem chừng đã lớn lắm rồi. Anh nhớ lần đầu thấy cậu ta thì cậu ấy chỉ là một đứa trẻ mười hai tuổi. Có điều là năng lượng cậu ta phát ra lại đen tối quá... Đúng là càng chìm sâu vào thù hận thì con người càng...

Cặp vợ chồng rời khỏi quán trà sau khi nhóm người đó đã rời đi một lúc lâu. Ilmany nói với chồng:

- Đúng là... gieo gió thì gặt bão...

Tại văn phòng Hokage, Danzo đang nhanh chóng sắp xếp mọi thứ để ông ta có thể lên đường vào ba ngày nữa. Văn kiện đang chất thành đống trên bàn nhưng ông ta dường như không mấy quan tâm. Thứ ông ta quan tâm lúc này là những suy tính của riêng ông với hội nghị sắp tới và sau đó. Mọi dự tính của ông ta đang dần trở thành sự thật khiến lòng ông lâng lâng cảm giác vui sướng. Tuy nhiên, cảm giác đó không được lâu vì hội nghị sắp tới ông sẽ phải gặp bốn kage còn lại để nói về Akatsuki và nhiều vấn đề khác. Ngoài ra, Tsunade mới chỉ nguy kịch chứ chưa chết. Đó sẽ là một quả bom nổ chậm nếu cô ta phục hồi nhưng đó sẽ là việc ông giải quyết sau khi về làng. Bây giờ, ông phải hoàn thành một số việc cấp thiết để đám dân làng tin rằng ông là một nhà lãnh đạo hơn hẳn các kage trước đây.

Một tháng sau, tại Kim quốc, trong một phòng họp là năm vị kage đang thảo luận về Akatsuki. Đại diện các làng gồm: Shimura Danzo – Hokage Đệ Lục của Konoha, Sabaku no Gaara – Kazekage Đệ Ngũ của Suna, A – Raikage Đệ Tứ của Kumo (làng Mây), Mei Terumi – Mizukage Đệ làng Kiri (làng Sương Mù), Onoki – Tsuchikage Đệ Tam của Iwa (làng Đá) đang thảo luận về nhiều vấn đề xảy ra gần đây, nhất là Akatsuki.

Cuộc hội thảo đang ở những hồi gay cấn khi mỗi kage đề "vì làng" mà tranh cãi dữ dội về việc hợp tác. Gaara với vai trò là Kazekage đã cố gắng lên tiếng thuyết phục họ:

- Akatsuki dẫu đã mất đi thủ lĩnh là Pain nhưng chúng vẫn là một tổ chức nguy hiểm. Điều bây giờ chúng ta cần là hợp lực cùng nhau để tiêu diệt nó.

Raikage là một người đàn ông tóc vàng, nước da ngăm với đôi lông mày lúc nào cũng nhíu lại và một gương mặt đỏ bừng. Ông đạp thẳng tay xuống bàn:

- Không. Đây là chuyện của mỗi làng. Chúng chỉ còn mấy tên cỏn con mà thôi.

Cả cuộc họp lộn tùng phèo hết cả lên khi mỗi người một ý. Gaara quay sang nhìn Hokage mới của làng, anh không ngờ lão già này cũng không khác những người kia là bao dù Konoha mới bị tấn công cách đây một tháng. Cậu biết rằng nếu như họ cứ cãi nhau thế này thì không những Akatsuki không bị giải quyết mà còn là nguy cơ chiến tranh giữa các làng. Cậu hiểu rõ sức mạnh của tổ chức này khi đã một lần chết trong tay chúng. Cậu đã hết lời khuyên can họ nhưng dường như khi họ chưa đối mặt với nó thì họ không nhận thức được tính nghiêm trọng của vấn đề. Vì lí do này, cậu thực sự nghi ngờ tên Danzo này có thực sự là đã chiến đấu trong trận chiến đó không hay hắn chỉ xem kịch. Gaara nhận ra hắn là một lão cáo già và có lẽ, hắn chỉ muốn thu vén lợi lộc về bản thân mình.

Giữa lúc hội nghị đang ồn ào thì bỗng Raikage quát lên:

- Tên nào đang ở đó?

Không thấy ai trả lời, ông ấy xông thẳng đến cửa vào với tốc độ chóng mặt và đấm vào tường. Một mảng tường lớn đổ sập. Người đứng phía sau tường chính là Sasuke và đội Taka của cậu ta: Karin, Suigetsu và Jugo. Họ đến đây với hai mục đích: phá hỏng hội nghị và giết Danzo. Sasuke không nói nhiều, cậu rút kiếm và chém vào A. Ông tránh đòn tấn công và đánh cho cậu một chưởng. Tốc độ của ông cực kì nhanh khi chưa nhìn thấy gì đã thấy tay của ông đang sắp đánh thẳng vào Sasuke. Một luồng sức mạnh màu tím dần bao bọc quanh người Sasuke và kết thành hình một bộ xương. Chính luồng sức mạnh này đã bảo vệ cậu ấy khỏi cú đấm của Raikage.

- Susanoo à?

Ngài Raikage không quá ngạc nhiên khi thấy nó. Ông có thể đoán ra nhẫn thuật này và biết được cậu ta đã có Mangekyou Sharingan – đôi mắt mạnh nhất của tộc Uchiha. Ông quyết định cho cậu thêm một đánh vì ông tự tin rằng mình có thể phá huỷ lớp giáp sắt. Nhưng thứ đón chờ trên tay ông chính là Hắc hoả Amaterasu. Raikage lùi lại. Ông không có cách nào dập tắt nó. Ông đưa ra quyết định chặt đứt tay để tránh ngọn lửa lan rộng. Ông làm rất nhanh mà không chút mảy may suy nghĩ hay đau đớn. Trận chiến tiếp tục, cả bốn kage đều tham chiến, trừ Danzo. Thấy đối tượng của mình chạy mất, Sasuke vẫn quyết định tiếp tục đánh với bốn kage còn lại. Cậu đang quá tự tin vào sức mạnh của mình sao?

Với đôi mắt Mangekyou Sharingan đã được cấy ghép, cậu hoàn toàn có thể sử dụng đôi mắt này bất cứ khi nào mình muốn mà không lo tác dụng phụ. Cậu dùng nó để dự đoán những tuyệt chiêu của đối thủ: Mei với thuỷ thuật kết hợp thổ thuật tạo nên lớp xi măng khô nhanh, cứng chắc; Gaara với nhẫn thuật điều khiển cát linh hoạt dù cậu ta đã mất Shukaku; A nổi tiếng với tốc độ của mình và lôi thuật của ông cực kì đáng gờm; kage còn lại là Onoki mặc dù đã già, hay bị đau lưng nhưng kinh nghiệm chiến đấu của ông là không thể xem thường khi ông dùng thành thạo Trần thuật biến hoá khôn lường. Sasuke cùng đồng đội tham chiến hết sức mình nhưng các kage đã cho thấy họ có thể ngồi được ở vị trí này là có lí do của nó. Không mất quá nhiều thời gian để Sasuke nhận ra rằng mình đang dần yếu thế trong trận chiến này, nhất là Raikage khi ông vừa mạnh lại vừa khoẻ đã gây không ít khó khăn cho cậu. Giữa lúc này, một kẻ đeo mặt nạ cam xuất hiện, hắn bảo Sasuke:

- Đi tìm hắn đi.

Sasuke rời đi cùng mọi người, trong khi đó, Tobi – kẻ đeo mặt nạ cam – tiếp tục trận chiến.

Danzo đã ở bên ngoài khu vực họp. Hắn đang chạy trốn. Dẫu sao cái ghế đó hắn ngồi chưa nóng thì làm sao có thể chết như vậy. Hắn chỉ không ngờ rằng Sasuke rất nhanh đã chắn trước mặt hắn. Hắn định gọi hai hộ vệ của mình nhưng nhận ra họ đã biến mất. Hắn hiểu rằng trận chiến này hắn phải tự mình đối mặt với Sasuke – kẻ khao khát trả thù làng, nhất là hắn, người đứng sau trận thảm sát gia tộc năm đó và là kẻ đẩy Itachi và Sasuke vào con đường anh em tương tàn. Hắn bình tĩnh tháo cánh tay bị bọc kín và mở bên mắt còn lại. Bên trong những dải băng đó chính là mười con mắt sharingan mà hắn có được và con mắt của Uchiha Shisui, thứ mà hắn đã cướp của cậu ấy. Để có được sức mạnh duy trì, hắn đã cấy ghép một phần tế bào Đệ Nhất vào cánh tay và một bên mặt dẫn đến những phần đó có màu trắng chết chóc. Hắn rất tự tin với sức mạnh của mình, nhất là khi hắn có mắt của Shisui, đôi mắt với ảo thuật sharingan mạnh nhất – Kotoamatsukami - ảo thuật cho phép ông điều khiển bất kì ai mà họ không hề hay biết. Điểm yếu duy nhất của ảo thuật này chính là mỗi mười năm mới có thể sử dụng một lần nhưng với việc cấy ghép tế bào Đệ Nhất, cứ cách vài giờ là ông ta có thể sử dụng nó. Ông ta đã dùng Kotoamatsukami và Mifune của làng Kiri để lấy thông tin trong nhiều năm qua và ông còn có ý định sử dụng nó trong đại hội lần này với các kage khác nhưng chưa kịp thì đã bị đám phiền phức này ngăn lại.

Để nhanh chóng chiến thắng, hắn đã dùng Izanagi vào Sasuke khiến cậu chìm vào ác mộng về anh trai mình. Điều này càng khoét sâu vào vết thương trong trái tim của cậu. Với lòng hận thù sâu sắc cùng tài năng của mình, cậu không mất quá lâu để thoát khỏi nó nhưng di chứng của nó vẫn ảnh hưởng đến cậu tận một ngày sau. Ngay khi thoát khỏi ảo thuật, cậu đã nhanh chóng chém đứt cánh tay sharingan của hắn.

Thấy không hiệu quả, ông ta đã triệu hồi Baku. Baku đã dùng sức mạnh hút của mình để hỗ trợ cho các đòn phong thuật của Danzo khiến Sasuke gặp không ít khó khăn. Gió có thể dập được lửa nhưng là thứ làm lửa mạnh hơn. Sasuke đã lợi dụng điều này mà tiêu diệt Baku. Hắn không nao núng mà tiếp tục dùng mộc độn và thuỷ độn tấn công cậu. Dù sao Danzo cũng là một lão cáo già khi các chiêu thức của hắn kết hợp với nhau cực kì hiệu quả làm cậu đã bị thương không ít và phải dùng đến Susanoo và Hắc hoả.

Khi Sasuke đang phân tâm vì phải tìm Danzo thì hắn đã tấn công mạnh vào cậu. Karin lao ra đỡ và bị dính một chưởng mạnh. Sasuke bỏ mặc cô ấy mà tiếp tục giết hắn. Danzo không ngờ Sasuke lại vô tình đến vậy nhưng cuộc chiến vẫn phải tiếp tục.

Sasuke cách kẻ thù của mình ngày càng gần. Cậu quyết định tung một nhát chém kết thúc mọi chuyện vì lúc này Danzo đã quá yếu. Ngay khi cậu định xuống kiếm thì cả người cậu tê liệt. Hoá ra, tên này rất giỏi thuật phong ấn và đã sử dụng nó khiến cậu tê liệt, đây cũng là cách hắn kiểm soát toàn bộ Root. Tuy nhiên, việc dùng nó đã khiến hắn đi đến bờ vực của cái chết. Biết mình không còn sống được nữa, hắn đã khởi động Tứ biểu tượng ngược. Trên người hắn xuất hiện bốn biểu tượng của Tứ tượng từ máu. Bốn biểu tượng phát ra xung quanh tạo thành một quả cầu màu đen hút tất cả mọi thứ phong ấn vào cơ thể của người thi triển. Không may, đội Taka, trừ Karin là nằm trong phạm vi ảnh hưởng. May mắn là Jugo đã kịp thời đưa cậu ra ngoài. Ngay khi thuật kết thúc, mọi thứ xung quanh Danzo không còn thứ gì, chỉ còn lại cái xác không hồn của hắn. Phong ấn trên người Sasuke biến mất, cậu lại gần hắn, nhìn hắn đầy khinh thường rồi bỏ đi và bỏ cả Karin.

Ngay trong ngày hôm đó, tin tức về Danzo đã về đến làng. Hắn đã chết. Hắn đã được trở thành Hokage theo ý hắn nhưng chỉ được một tháng đã biến hắn thành Hokage có thời gian tại vị ngắn nhất trong lịch sử và là vị Hokage duy nhất không được khắc lên núi. Hắn sẽ trở thành vị Hokage chỉ được ghi vài dòng trong sách và không còn thứ gì nữa. Ngay khi hắn mất, Root đã tan rã thực sự. Các thành viên trong đó trở về với cương vị ninja chính thức hoặc trở thành anbu cho làng. Tuy nhiên, Tsunade vẫn chưa tỉnh lại và hội đồng đã quyết định để Kakashi trở thành Hokage Đệ Lục thay vì Đệ Thất vì dù sao thời gian đương nhiệm của Danzo ít, lại không làm được gì cho làng, đã thế hắn còn đe doạ họ và lãnh chúa nên tốt nhất để cái tên của hắn ghi lại trong sách là được rồi.

Ban đêm, gần nơi Danzo chết, Madrid đang tìm kiếm cái gì đó. Cuối cùng cậu cũng tìm ra nó: cánh tay bị mất của Danzo. Cậu men theo dấu vết của đội hộ tống Konoha và tìm ra vị trí nghỉ ngơi của họ. Chỉ với vài thao tác, cậu đã lấy được con mắt của Shisui và thay cho hắn một con mắt giả giống như thật. Cậu vui mừng cất nó đi và rời khỏi nơi này.