Đêm khuya – Trường THPT Kỹ Thuật Tokyo Số 7X đứng trên tầng thượng khu ký túc xá, ánh mắt dõi theo những vì sao mờ ảo. Trong lòng cậu là một cơn bão: MG-001 đã xuất hiện, KuroKage đang hành động, và Y – người con gái mà cậu bắt đầu tin tưởng – đang mang trong mình sợi dây gắn liền với tương lai thế giới.Đột nhiên, âm thanh trầm vang vọng từ dưới lòng đất truyền qua nền bê tông. Một rung chấn nhẹ. X khẽ cau mày.Không phải động đất. Đó là... tín hiệu từ hệ thống ngầm.Phòng điều khiển phụ – Tầng hầm thứ 7 của trường (khu vực bị đóng từ Thế Chiến Cơ Giáp Thứ Hai)Y cùng X lần đầu đột nhập vào khu cấm.Khói bụi phủ mờ ánh đèn. Tường xi măng dày với dấu hiệu ăn mòn của thời gian. Họ tìm thấy một cánh cửa kim loại lớn có biểu tượng đặc biệt: một hình xoắn ốc bao quanh chữ MG – biểu tượng cổ của Mugen đời đầu.X đưa tay chạm vào bảng điều khiển. Một ánh sáng xanh lục phát ra, nhận diện sinh trắc học."Hệ thống xác nhận: Huyết thống hợp lệ – Tiến sĩ X [Mẫu Gen: 00-X]."Cánh cửa mở ra.Phía bên trong, một phòng lab tối om hiện ra, nhưng ở giữa lại sáng lên một trụ chứa tinh thể năng lượng hình tim – vật thể có vẻ đang hoạt động."Đây là..." – Y thốt lên, bước đến gần."Mugen Core – Trái Tim Chiến Thuật Đầu Tiên."Dòng chữ ảo hiện trên không trung. Đây không phải chỉ là một lõi năng lượng – mà là nền tảng gốc của Mugen, thứ từng bị chôn giấu khỏi lịch sử.Y đặt tay lên tinh thể. Đúng lúc ấy, một đoạn dữ liệu tràn vào não cô:"Nếu ai đó đang đọc dòng này, thì MG-001 đã sắp tỉnh. Tôi là Tiến sĩ X, và các người không thể ngăn được nó... nếu không đánh thức Mugen thực sự. Nhưng để làm điều đó, Trái Tim Đồng Bộ – phải lựa chọn."Trong lòng Y, đoạn dữ liệu mở ra một đoạn ký ức không thuộc về cô.Cô thấy chính mình... hay đúng hơn là một cô gái rất giống cô, đứng giữa chiến trường Mugen cổ đại, nắm tay một thiếu niên – là X, hoặc ai đó giống hệt X – cả hai đang đối đầu với một đội cơ giáp khổng lồ có ký hiệu MG-001.Trận chiến kết thúc trong ánh sáng trắng. Mọi thứ sụp đổ.Y ngã quỵ.Hiện tại – Tầng hầm trường họcX đỡ lấy Y đang run rẩy."Cô thấy gì?""Chúng ta đã... từng chiến đấu. Nhưng không phải ở đây. Có thể là... một vòng lặp? Một thực tại khác? Một ký ức bị tái tạo?" – Y lắp bắp.Cùng lúc đó, từ hệ thống loa cũ kỹ, một giọng nói điện tử vọng lại, quen thuộc đến đáng sợ:"Xin chào... con trai của ta."Mọi thứ đóng băng. Đó là giọng của Tiến sĩ X – nhưng ông đã chết từ Thế Chiến Cơ Giáp Thứ Hai.Bên ngoài Tokyo – Căn cứ bí mật KuroKageMG-001 đang được hoàn thiện. Lõi năng lượng đã sẵn sàng. Một hình dáng cơ giáp cao gần 20 mét, lớp giáp đen như hố đen vũ trụ, tràn ngập các chi tiết đỏ máu như mạch thần kinh."Chỉ cần Trái Tim Đồng Bộ chạm vào MG Core, MG-001 sẽ nhận được quyền đồng bộ cuối cùng." – một trong các kỹ sư thốt lên."Và khi đó, chúng ta không cần loài người nữa. Chúng ta sẽ trở thành thần."Trong bóng tối, một đoạn dữ liệu cuối cùng xuất hiện trên máy tính của X và Y:"Có tổng cộng 7 lõi MG được giấu khắp thế giới. MG-001 chỉ là khởi đầu. Nếu chúng thức tỉnh cùng lúc... không còn gì có thể cứu lấy nhân loại."